دوره 23، شماره 2 - ( تابستان 1400 )                   جلد 23 شماره 2 صفحات 102-85 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Esmaeili F, Zolghadri S. Bioinformatics analysis of gene expression profile in women with major depressive disorder. Advances in Cognitive Sciences 2021; 23 (2) :85-102
URL: http://icssjournal.ir/article-1-1224-fa.html
اسماعیلی فرناز، ذوالقدری سمانه. تحلیل بیوانفورماتیکی نیم‌رخ بیان ژن در زنان دارای اختلال افسردگی اساسی. تازه های علوم شناختی. 1400; 23 (2) :85-102

URL: http://icssjournal.ir/article-1-1224-fa.html


1- دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک، گروه زیست‌شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم، فارس، ایران
2- استادیار بیوفیزیک، گروه زیست‌شناسی، واحد جهرم، دانشگاه آزاد اسلامی، جهرم، فارس، ایران
چکیده:   (3124 مشاهده)
مقدمه:اختلال افسردگی اساسی، یک اختلال روانی است که در زنان دو برابر مردان رخ می­دهد. در هر دو جنس، میانگین سن مبتلایان به اختلال افسردگی اساسی حدود 25 سال است. مطالعات خانوادگی و دوقلویی و اپیدمیولوژیک همه به ویژگی­‌های چند­عاملی و چند­ژنی صفات روان­‌پزشکی اختلال افسردگی اساسی اشاره دارند. هدف از این مطالعه، غربال­گری ژن­‌های مرتبط با بیماری­‌زایی اختلال افسردگی اساسی توسط بیوانفورماتیک بود.

روش کار: با استفاده از داده‌های ریزآرایه GSE98793 از پایگاه داده GEO، 223 ژن متفاوت بیان شده (DEGs) از مقایسه نمونه‌­های زن بیمار با کنترل توسط نرم­‌افزار TAC به دست آمد. ژن­‌های Hub از طریق STRING و Cytoscape و سپس روش غنی­‌سازی KEGG غربال­گری شدند.

یافته‌­ها: در مقایسه نمونه­‌های زن بیمار با گروه کنترل 103 ژن افزایش بیان و120 ژن کاهش بیان نشان دادند. نتایج تجزیه و تحلیل غنی­‌سازی مسیر KEGG و panther از مقایسه نمونه­‌های زن بیمار با گروه کنترل نشان داد که DEG­ها عمدتاً در مسیر سیگنال­‌رسانی HIF-1، مسیر سیگنال­‌رسانی FOXO، مسیر تمایز سلول­‌های Th-17، مسیر سیگنال­‌رسانی PI3K-Akt، مسیر مرگ برنامه­‌ریزی شده­ سلول (فروپتوزیز) و مسیر سنتز پورین­‌ها مهم بودند. نتایج این مطالعه نشان داد که ژن­‌های IGF1R و ATM با افزایش بیان و ژن GMPS با کاهش بیان برای زنان این بیماری نیز می­‌تواند گزینه­ مناسبی جهت اهداف درمانی باشند.

نتیجه­‌گیری: ژن­‌های کلیدی که با تجزیه و تحلیل داده­‌های ریزآرایه در مطالعه حاضر به دست آمد، سرنخ­‌های مهمی برای آشکار کردن­‌ساز و کار مولکولی و درمان هدفمند بالینی افسردگی در زنان فراهم می­کند.

متن کامل [PDF 2516 kb]   (785 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: علوم اعصاب شناختی
دریافت: 1399/9/22 | پذیرش: 1400/2/6 | انتشار: 1400/6/2

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

Designed & Developed by : Yektaweb