اختلال شناختی هسته بیماری اسکیزوفرنیا است. مشکلات حافظه، توجه و عملکردهای اجرایی حتی در افرادی که مبتلا به اسکیزوفرنیا هستند و عملکرد هوشی متوسطی هم دارند و یا آنهایی که اولین اپیزود حادثه بیماری را تجربه می‌کنند نیز وجود دارد. علاوه بر این، به نظر نمی‌رسد که نقایص شناختی در بیماران مبتلا به اسکیزوفرنیا با داروهای آنتی‌پسیکوتیک بهبود یابد و این علایم حتی زمانی که شکایت‌های روانی با درمان بهتر می‌شوند نیز باقی می‌مانند. نقایص‌شناختی همچنین می‌توانند پیشگویی‌کننده تعداد بستری‌های بعدی، طول مدت بستری و میزان بهبود بالینی باشند.